因滴虫阴道炎可同时有尿道、尿道旁腺、前庭大腺滴虫感染，欲治愈此病，需全身用药，主要治疗药物为甲硝唑及替硝唑。
1.全身用药 初次治疗推荐甲硝唑2g，单次口服;或替硝唑2g，单次口服。也可选用甲硝唑400mg，2次/d，连服7天;或替硝唑500mg，2次/d，连服7天。女性患者口服药物的治愈率为82%～89%，若性伴侣同时治疗，治愈率达95%。服药后偶见胃肠道反应，如食欲减退、恶心、呕吐。此外，偶见头痛、皮疹、白细胞减少等，一旦发现应停药。治疗期间及停药24h内禁饮酒，因其与乙醇结合可出现皮肤潮红、呕吐、腹痛、腹泻等反应。甲硝唑能通过乳汁排泄，若在哺乳期用药，用药期间及用药后24h内不宜哺乳。